Если завершить сеанс с раскладкой ru, то при новом сеансе будет отображаться ru, а на самом деле будет английский. Переключившись на английский, будут печататься русские буквы. Думаю нужно отключить запоминание раскладки по завершении сеанса.
После обновления до Gnome 3.8 проблема более не возникает. Закрывайте баг.
Проблемы давно уже нет. Закрывайте баг.
Исправлено.