в /etc/chroot.d/mysql.conf вместо запуска copy_resolv_conf используется некорректный c-n-p оттуда, в результате service mysqld adjust не работает, в частности, без /etc/localtime, что является вполне корректной ситуацией.
У тебя часом нет проверенного исправленного варианта?
Исправил, проверил.
MySQL-5.5.30-alt2 -> sisyphus: * Mon Mar 04 2013 Michael Shigorin <mike@altlinux> 5.5.30-alt2 - fixed chrooted configuration (closes: #28630)
