Свежий sсilab ищет файл matioConfig.h, но он не включен в libmatio-devel (хотя есть в исходниках). Прошу пересобрать с включением. P.S. Заодно можно и версию обновить: выпущена 1.5.1 (http://sourceforge.net/projects/matio/files/latest/download)
Прошу собрать новую версию. С matioConfig.h разобрался, достаточно matio_pubconf.h
libmatio-1.5.1-alt1 -> sisyphus: * Wed May 01 2013 Eugeny A. Rostovtsev (REAL) <real at altlinux> 1.5.1-alt1 - Version 1.5.1 (ALT #28910)