Наблюдается на Firefox и Сhromium; возможно — не только. При открытии .swf-файла с диска предлагает его скачать или обработать любой установленной программой, у которой в .desktop-файле сказано, что она обрабатывает application/x-shockwave-flash или application/futuresplash (например, vlc и gnash). Заставить броузер открывать файл плагином нельзя — нет соответствующей настройки.

Ошибка эта, возможно, апстримная (я пробовал ванильный FF — та же история).

Объезд: поудалять соответствующие привязки в .desktop-файле и перегенерировать кэш:

# f='application/(x-shockwave-flash|futuresplash)(;|$)'; egrep -Zrl "$f" /usr/share/applications/ | xargs -0n1 sed -ri "s@$f@@g"
# update-desktop-database

Ошибка может быть важной при использовании кроссплатформенных приложений на современном flash (пример: http://www.cambridge.org/us/esl/catalog/subject/project/item405083/?site_locale=en_US)