предыдущая сборка каким-то образом обеспечивала существование /usr/lib/jdk, нынче же, с появлением java-1.7.0-openjdk-1.7.0.79-alt2_2.5.5.0jpp7, такого пути нет. Печаль.
/usr/lib/jvm/java/include/jni.h ?
какое приложение там ищет? или это где-то alt-specific в пакетах?
пакет, переставший собираться, искал в $JDK_HOME, я выставлял его равным /usr/lib/jdk.
Ок, спасибо. /usr/lib/jdk --- это до конвенций JPackage, анахронизм.