в итоге не работают, как предполагается, команды типа: $ make BLA-BLA.iso THE_PACKAGES+='some packages' То есть они работают, но предыдущее содержимое переменных (THE_PACKAGES) теряется.
Стоит заметить, что "и не обещали": http://www.altlinux.org/Mkimage/Profiles/m-p/FAQ Воспроизводится, но беглый осмотр не показал места, где бы перебивалось. Если сможешь, найди, поправь и сообщи. Если нет -- когда получится, перегруз.
Такая возможность не будет реализована.