После того, как накатил kde5-kmail-17.04.2-alt1.S1.x86_64 удаление писем ведет себя не адекватно: после удаления в корзину/перемещения в другую папку письма не всегда удаляются из исходной, а продолжают висеть в списке. После перезапуска kmail удаленные письма пропадают. Такое было когда-то, не помню, где лечилось в самом kmail или где-то в akonadi. Кстати, после установки всех новых версий akonadi честно проиндексировал все заново.
Сейчас подобных лагов стало сильно меньше. Когда akonadi с MySQL ещё что-то делают, а в UI уже хочется увидеть результат.