ALT Linux Bugzilla – #34263

Чтобы xcos заработал пришлось откатить jgraphx и batik. До этого

$ xcos
Внимание: не удалось найти пакет Java «/usr/share/java/jgraphx.jar».
При загрузке библиотек Java были некоторые проблемы.
Это может привести к неожиданному поведению.
Проверьте SCI/etc/classpath.xml.
Внимание: не удалось найти пакет Java «/usr/share/java/jgraphx.jar».
java.lang.NoClassDefFoundError
com/mxgraph/swing/mxGraphComponent

После отката
Обновление / установка...
1: jgraphx-2.5.1.0-alt1                 ################################################################## [ 50%]
Очистка / удаление... 
2: jgraphx-3.6.0.0-alt1_3jpp8           ################################################################## [100%]
Done.

получаем следующее:
$ xcos
java.lang.reflect.InvocationTargetException
        at java.awt.EventQueue.invokeAndWait(EventQueue.java:1321)
        at java.awt.EventQueue.invokeAndWait(EventQueue.java:1296)
        at javax.swing.SwingUtilities.invokeAndWait(SwingUtilities.java:1348)
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.getInstance(Unknown Source)
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.getInstance(Unknown Source)
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.xcos(Unknown Source)
Caused by: java.lang.RuntimeException: Не удалось загрузить библиотеку Batik.
Ожидалась версия 1.7 ; установлена версия 1.9 .
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.checkDependencies(Unknown Source)
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.<init>(Unknown Source)
        at org.scilab.modules.xcos.Xcos.lambda$getInstance$2(Unknown Source)
        at java.awt.event.InvocationEvent.dispatch(InvocationEvent.java:301)
        at java.awt.EventQueue.dispatchEventImpl(EventQueue.java:756)
        at java.awt.EventQueue.access$500(EventQueue.java:97)
        at java.awt.EventQueue$3.run(EventQueue.java:709)
        at java.awt.EventQueue$3.run(EventQueue.java:703)
        at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
        at java.security.ProtectionDomain$JavaSecurityAccessImpl.doIntersectionPrivilege(ProtectionDomain.java:80)
        at java.awt.EventQueue.dispatchEvent(EventQueue.java:726)
        at java.awt.EventDispatchThread.pumpOneEventForFilters(EventDispatchThread.java:201)
        at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForFilter(EventDispatchThread.java:116)
        at java.awt.EventDispatchThread.pumpEventsForHierarchy(EventDispatchThread.java:105)
        at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:101)
        at java.awt.EventDispatchThread.pumpEvents(EventDispatchThread.java:93)
        at java.awt.EventDispatchThread.run(EventDispatchThread.java:82)
Caused by: java.lang.Exception
        ... 17 more
java.lang.NullPointerException

 at org.scilab.modules.xcos.Xcos.xcos(Unknown Source)

Откатываем batik до 0:1.8-alt3_6jpp8, после чего xcos запускается.