Из Gnome 2.4 Administration Guide: The application registry is a location that contains text files which register applications. В Sisyphus, это находится в /usr/share/application-registry и содержит файлы из различных пакетов, но сам каталог не принадлежит ни одному пакету. Я думаю, этот каталог должен быть приписан к gnome-desktop, так же как /usr/share/applications сейчас.
То же самое можно сделать для /usr/share/mime-info
$ rpm -qf /usr/share/application-registry gnome-desktop-2.6.1-alt1