При запуске возникает такое сообщение, после чего программа завершается. Как ни странно, код возврата — 0.
Всё потому, что файлы /etc/profile.d/qt5ct.csh и /etc/profile.d/qt5ct.sh не исполняемые. /etc/profile игнорирует не испольняемые файлы из /etc/profile.d, и переменная не выставляется.
qt5ct-0.37-alt1 -> sisyphus: Fri Feb 01 2019 Ivan A. Melnikov <iv@altlinux> 0.37-alt1 - New version - Make /etc/profile.d/qt5ct* executable (closes: #35769)