boot entry для него выглядит так: Boot0002* Linux-Firmware-Updater HD(1,GPT,9b1f0a6f-d7f6-7341-82c1-129087a051b1,0x800,0x7f800)/File(\EFI\altlinux\shimx64.efi)\.f.w.u.p.d.x.6.4...e.f.i... сам fwupd выдал после неудачного обновления эту ссылку: https://github.com/fwupd/fwupd/wiki/LVFS-Triaged-Issue:-Failed-to-run-update-on-reboot
shim-signed обновлен, проблема должна решиться. При необходимости переоткройте багу.