Предлагаю сделать в нашем apt операцию upgrade не самостоятельной, а вторым названием операции dist-upgrade -- чтобы переходящим с дебиана было проще (там исторически не менялся граф зависимостей в рамках стабильной ветки, насколько понимаю; равно как и в шляпе, чтобы обновление выполнялось rpm -Fvh *.rpm).
Не дубль ли этого https://bugzilla.altlinux.org/30867 ?
Некоторые ещё апгрейдят систему через apt-get update Интересно, можно ли это как-то определить и вывести варнинг? Скажем, запоминать когда был сделан dist-upgrade последний раз (или когда был установлен любой пакет) и если он делался больше месяца назад, то apt-get update выводит полезное сообщение, что система давно не обновлялась и рекомендуется сделать apt-get dist-upgrade.