При переключении в сеанс wayland пропадает индикатор раскладки, а из настроек KDE попадают обе раскладки (русская и английская), а так же пропадает текущая привязка переключения раскладки к сочетанию клавиш. В итоге ввод на русском невозможен.
Пока придётся настроить раскладку в KDE у пользователя, т.к. в X-ах она читается из X-ов.
Теперь достаточно настроить раскладку в alterator