В нынешней Mesa опции -Dvulkan-overlay-layer больше нет -- вынесли в список; предлагаю сделать -Dvulkan-layers=device-select,overlay (добавлял на %e2k по предложению коллег из @elbrus_pc_test, полезно для анализа производительности).
Виноват, в сизифном Mesa.spec уже так и есть: -Dvulkan-layers='device-select, overlay' \