В logrotate-файле transmission-daemon используется init-скрипт. Надо хотя бы использовать утилиту service, которая сама определяет systemd.
transmission-4.0.6-alt2 -> sisyphus: Tue Jun 25 2024 Mikhail Tergoev <fidel@altlinux> 4.0.6-alt2 - use service in logrotate (ALT bug: 49869)