В Gnome установлена смена раскладки - "своя для каждого окна", по умолчанию английская. Когда появляется окно с запросом ввода пароля администратора, раскладка в нем та, которая была в последнем активном окне, а должна быть английская.
Воспроизводится в Sisyphus, версия пакета: gdm-48.0-alt4 Вероятно, данный MR сможет помочь, когда будет принят: https://gitlab.gnome.org/GNOME/gnome-shell/-/merge_requests/3681