Сейчас у Discover/Gnome-Software присутствует не совсем очевидное для простого пользователя поведение. Дело в том, что при установке некоторых пакетов, на самом деле устанавливаются мета-пакеты. При этом в Discover/Gnome Software нигде нет на это указания. При удалении, соответственно, удаляется сам мета-пакет, а все, что было установлено в составе него, остается в системе. Это поведение соответствует тому же, что происходит при удалении мета-пакета через консоль, т.е. не является ошибкой. Но в консоли указывается, какие пакеты будут удалены, в то время как при удалении через Discover/Gnome Software этой информации нет. В итоге для пользователя все выглядит так, будто пакет он удалил, но из системы тот никуда не делся. Примеры: Медиаплеер VLC (устанавливает и удаляет vlc-maxi), Remmina (устанавливает и удаляет remmina-plugins) После удаления в системе остаются vlc и remmina, и их все еще можно использовать. Было бы неплохо, если бы пользователь хотя бы мог понять, какие именно пакеты удаляются и почему после "удаления" пакета он все еще рабтает.