Шаги воспроизведения:
1. Установить git
2. Добавить в систему gpg ключ.
3. Добавить в git соответствующие настройки:
> git config --local user.signingKey <id-ключа>
> git config commit.gpgSign true
4. Делаем коммит

Ожидаемое поведение:
Коммит будет подписан

Фактическое поведение:
Получаем ошибку следующего вида:
> error: gpg failed to sign the data
Понятно, что ничего не понятно.
Как оказалось, git не настроен на работу с gpg ключами, а именно с gpg2.
После выполнения данной команды:
> git config --global gpg.program gpg2
Ключ начинает применяться. Проверить можно командой:
> echo "test" | gpg2 --clearsign

В дополнение скажу что в Fedora такой проблемы нет. Поддержка gpg для git включена "из коробки".
Так же была проблема после импорта ключа вывести список добавленных ключей.
Команда:
> gpg --list-keys
Ничего не показывала (хотя в Fedora всё отрабатывало штатно)
Оказывается нужно было вызвать gpg2 и тогда я получал необходимый вывод:
> gpg2 --list-keys