Предлагаю выделить из libgio непосредственно саму библиотеку, чтобы пакеты собранные с поддержкой gio не тянули с собой весь ворох его зависимостей. Это нужно в частности для polkit, который необходим для run0, чтобы их можно было использовать на сервере.
Почему notabug? Вот эти пакеты тянутся: gsettings-desktop-schemas-data gsettings-desktop-schemas pkg-config shared-mime-info desktop-file-utils