Версия пакета: flameshot-13.3.0-alt1

Конфигурация:
Screen 0: minimum 16 x 16, current 2048 x 768, maximum 32767 x 32767
Virtual-1 connected primary 1024x768+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 0mm x 0mm
   1024x768      59.92*+
   800x600       59.86  
   640x480       59.38  
   320x240       59.29  
   960x600       59.63  
   928x580       59.88  
   800x500       59.50  
   768x480       59.90  
   720x480       59.71  
   640x400       59.95  
   320x200       58.14  
   1024x576      59.90  
   864x486       59.92  
   720x400       59.27  
   640x350       59.28  
Virtual-2 connected 1024x768+1024+0 (normal left inverted right x axis y axis) 0mm x 0mm
   1024x768      59.92*+
   800x600       59.86  
   640x480       59.38  
   320x240       59.29  
   960x600       59.63  
   928x580       59.88  
   800x500       59.50  
   768x480       59.90  
   720x480       59.71  
   640x400       59.95  
   320x200       58.14  
   1024x576      59.90  
   864x486       59.92  
   720x400       59.27  
   640x350       59.28  

Шаги воспроизведения:
1) $ flameshot
2) ЛКМ по иконке в трее

Фактический результат:
flameshot взаимодействует только с основным экраном. Невозможно выбрать область на другом экране.

Подтверждаю - на р11 с Wayland так же. flameshot-12.1.0