Предлагается изменить стартовый скрипт на прямой вызов #!/bin/sh /usr/lib/qcad/qcad "$@" При этом qcad может найти свои каталоги (поскольку ищет их от пути к бинарнику), и начинает работать вызов qcad файл, поскольку скрипт не меняет текущий каталог.
Поправил. Действительно, так лучше.
