Два проявления:
1. Делаю "вручную" изменения меню (конкретный пример - в позиции для Quanta
указываю запускать не собственно quanta, а мой скрипт, из коего она должна
запускаться. При перезапусках KDE врямя от времени обнаруживаю в этой позиции
то, что там было по умолчанию. При этом ничего вроде menu-updates мною не
запускалось.
2. Еще более регулярно (хотя тоже не со 100% воспроизводимостью) "слетают"
установленные мною ассоциации файлов. Причем, как установленные через позицию
"Открыть в" (правомышное выпадающе меню в Komqueror) - несмотря на простановку
галочки в "Запомнить связь..." и последующее открытие "прогрессив-окошка" с
"Обновление конфигурации", так и установленные через "Центр управления KDE".
   Система: Citron (Master 2.4) полученная как dist-upgrade из Compact 2.3 с
Updates (но без Сизифа!).