чтобы поставить прогамму, которо нет в Сизифе, скачал Мадрейковский rpm. В Мандрейке некоторые пакеты называются по другому, так что ставить прищлось с - -nodeps В результате, если Синаптику не жать снести этот пакет, он вообще ничего не делает. IMHO долженбыть способ объяснить ему, что на некоторые пакеты он смотреть не должен!
А что говорит про такой пакет APT? Если пакет имеет неудовлетворенные зависимости, то скорее всего ни апт, ни синаптик работать не будут... Однако ода имеют средства чтобы исправить эту ситуацию: apt: ключик --fix-broken synaptic: Меню -> Редактирование -> Исправить пакеты "с ошибками" Как вариант - попробуйте поставить на холд, но не ручаюсь, что это поможет