пакет не должен предоставлять /etc/chroot.d
предлагаю временно убрать пакет из Sisyphus, пока не будет исправлен - он все ломает.
Алексей, можешь добавить проверку в sisyphus_check'овский check_content()?
Починил в alt0.9, который уже в инкаминге