Файл /etc/emacs/site-start.d/chess.el не выполняется корректно - (require 'chess-auto) выдаёт ошибку: Required feature chess-auto was not provided Нужно либо использовать (load "chess-auto") вместо (require 'chess-auto), либо исправить генерацию chess-auto.el, чтобы в файл добавлялось (provide 'chess-auto).
Да там к тому же в (setq-default 'chess-sound-directory "/usr/share/emacs/site-lisp/chess/sounds") (setq-default 'chess-images-directory "/usr/share/emacs/site-lisp/chess/pieces") лишние "'".
если можете, то исправьте и перезалейте
Исправлено в emacs-chess-2.0-alt2.b5
