Тэги <DefaultAppDirs/> <DefaultDirectoryDirs/> <DefaultMergeDirs/> <KDELegacyDirs/> в файлах /etc/xdg/menus/applications-gnome-merged/* - лишние, т.к. они есть в главном файле /etc/xdg/menus/applications.menu
applications-gnome-merged прекратил своё существование.
Не прекратил, он теперь в /etc/gnome/xdg/menus/applications-merged/applications.menu
Я запутался. Этот новый /e/g/x/m/applications-merged/applications.menu нужно выбросить?
Ничего не нужно выбрасывать. Только убрать из /etc/gnome/xdg/menus/applications-merged/applications.menu тэги <DefaultAppDirs/> <DefaultDirectoryDirs/> <DefaultMergeDirs/> А <KDELegacyDirs/> там и так закоментирован. В /etc/xdg/menus/applications.menu они есть, поэтому нет смысла их дублировать.
fixed in gnome-menus-2.22.1-alt2