/var/lib/ldap/bases/DB_CONFIG: set_flags DB_TXN_NOT_DURABLE необходимо заменить на set_flags DB_LOG_INMEMORY т.к. DB_TXN_NOT_DURABLE более не работает. Совсем. Подробности вот здесь: http://www.openldap.org/lists/openldap-devel/200411/msg00043.html
Стоит также упомянуть, что для нормального использования DB_LOG_INMEMORY необходимо, чтоб значение set_lg_bsize было больше чем set_lg_max. Иначе slapd просто не запустится.
C libdb4.3 все эти изменения делать не стоит. Многие возможности либо не поддерживаются, либо работают нестабильно. Закрываяю bug.