Пакет nagios-www-2.0-alt0.b3.1 Файл /etc/nagios/cgi.cfg В первых строчках: main_config_file=/etc/nagios.cfg хотя должно быть main_config_file=/etc/nagios/nagios.cfg Из за этого cgi скрипты не работают.
В том же файле cfg.cgi еще один неправильный путь (не показывает картинки на статус-карте): - physical_html_path=/usr/share + physical_html_path=/usr/share/nagios/html
Исправлено в 2.0-alt1.