Модули не подгружаются автоматически. В proftpd.conf надо добавить строчку из README.DSO <IfModule mod_dso.c> LoadModule mod_ldap.c LoadModule mod_sql.c LoadModule mod_sql_mysql.c </IfModule> либо описать отдельно в README.ALT
Fixed in 1.3.0rel-alt1.1.