Эту базу =/var/cache/man/whatis= можно пересоздать вручную, используя =makewhatis=, после чего все работает хорошо.  Проверено, что триггеры =rpm= при установке и удалении пакетов отрабатываются нормально.  Но после презагрузки даже в одиночный режим (режим 1), в каталоге =/var/cache/man= исчезают все файлы (но каталоги остаются), и создается один файл =whatis= нулевого размера.  Службы =crond= и =anacron= в целях отладки временно выключены.  Более того, переключение между режимами с помощью =init 1/3/5= каталог =/var/cache/man= не меняет, база сохраняется.  Вот службы, которые стартуют на уровне 1:

# chkconfig --list|grep "1:on"
blk-availability        0:off   1:on    2:on    3:on    4:on    5:on    6:off
lvm2-lvmetad    0:off   1:on    2:on    3:on    4:on    5:on    6:off
lvm2-monitor    0:off   1:on    2:on    3:on    4:on    5:on    6:off
sysstat         0:off   1:on    2:on    3:on    4:on    5:on    6:off

Могу дать и полный список, если это важно.  Однако я заметил, что там еще кое-что делается, например, время настраивается.  Скриншот экрана загрузки сделать, увы, не могу.  В системных журналах на тему =whatis= только аудит моих действий по =sudo=.