В /usr/share/applications/panel-desktop-handler.desktop не хватает строки ShowOnlyIn=XFCE , т.к. за пределами Xfce оно не работает. http://standards.freedesktop.org/menu-spec/menu-spec-1.0.html#onlyshowin-registry Или переместить panel-desktop-handler.desktop в место доступное только Xfce.
(В ответ на комментарий №0) > ShowOnlyIn=XFCE Точнее, ShowOnlyIn=XFCE;
В Xfce все еще пытаются делать компоненты максимально независимыми друг от друга. И панель Xfce, в принципе, можно использовать без остального Xfce. Могу поставить NotShowIn=KDE; если в KDE мешает.
(В ответ на комментарий №2) > NotShowIn=KDE; Меня устроит.
xfce4-panel-4.12.0-alt3 -> sisyphus: * Fri Feb 12 2016 Mikhail Efremov <sem@altlinux> 4.12.0-alt3 - Don't try to use panel-desktop-handler in the KDE (closes: #31542).